Brasiilias avastati viirus teadusele tundmatute geenidega

Brasiilias avastati viirus teadusele tundmatute geenidega
Brasiilias avastati viirus teadusele tundmatute geenidega
Anonim

Teadlased avastasid Brasiilias uue viiruse, mille DNA on 90 protsenti teadusele tundmatutest geenidest. Avastuse tulemused avaldatakse bioRxivi eelprintimise saidil.

Viirus avastati Brasiilia Belo Horizonte linnas Pampulha tehisjärves. Selle mitte eriti keeruline genoom koosneb peaaegu täielikult teadusele tundmatutest geenidest. Autorid nimetasid uue viiruse Yaravirus brasiliensis Lõuna -Ameerika rahvaste mütoloogiast pärit vesinümfi Yara järgi.

Teadlased spekuleerivad, et nad seisavad silmitsi esimese juhtumiga, mille puhul on tegemist tundmatu isoleeritud viiruste rühmaga või hiiglasliku viiruse kauge liikiga, mis on muutunud väiksemaks.

Alles 21. sajandil avastatud hiiglaslike viiruste suurus on võrreldav bakteriraku omaga. Nad said oma nime nende tohutute kapsiidide - valgumembraanide, mis kapseldavad virioone - viiruseosakeste tõttu. Neil on ka sobiva pikkusega DNA, mis ületab 200 tuhat aluspaari ja sisaldab sageli niinimetatud orvude või orbude geene (ORFan), mida ei leidu üheski teises organismirühmas.

Komplekssed genoomid võimaldavad hiiglaslikel viirustel sünteesida valke ja teostada seetõttu DNA parandamist, replikatsiooni, transkriptsiooni ja translatsiooni. Enne nende avastamist usuti, et viirustel pole selliseid võimeid, kuna need on inertsed olendid, kes suudavad nakatada ainult nende peremehi. Kõik teadaolevad hiiglaslikud viirused on amööbide parasiidid.

Ja kuigi uue mikroorganismi suurus on hiiglaslike viiruste omast oluliselt väiksem - umbes 80 nanomeetrit - parasiteerib see ka amööbidel ja selle genoom on peaaegu täielikult orvuks jäänud: 68 selle geeni (üle 90 protsendi) ei leia analooge mis tahes tuntud organism ja ainult kuus ähmaselt sarnast teadusele teadaolevatega.

"Selle põhjuseks on asjaolu, et viirus on uus amööbiviiruse põlvkond, millel on hämmastav päritolu ja fülogenees," ütles üks uuringujuhtidest, Jônatas Abrahão Brasiilia Minas Gerais 'föderaalülikoolist.

Teadlased on analüüsinud üle kaheksa ja poole tuhande metagenoomi, kuid pole nende hulgast leidnud uue mikroorganismiga seotud viirusi. Sarnaselt teistele selle rühma viirustele esindab seda kaheahelaline DNA, mille pikkus on 44 900 aluspaari ja sisaldab 74 kodeerivat fragmenti.

"Standardprotokolle kasutades ei suutnud meie esimene geneetiline analüüs tuvastada yaraviiruses äratuntavaid kapsiidijärjestusi ega muid klassikalisi viirusgeene," selgitab Yonatas Abrajao ja teine uuringujuht Bernard La Scola Prantsusmaa Aix-Marseille'i ülikoolist.

Ametlike metagenoomiliste protokollide kohaselt ei saa yaraviirust isegi viiruseagendina ära tunda, kuna sellel pole nendega selget sarnasust. Teadlased ei oska veel öelda, kes ta tegelikult on - täiesti uue grupi esindaja või hiiglasliku viiruse järeltulija, mis kuidagi kujunes väiksemaks.

"Tundmatute valkude arv, mis moodustavad yaraviiruse osakesed, peegeldab viiruste maailmas esinevat varieeruvust ja seda, kui palju uusi viiruse genoome on veel avastamata," järeldavad autorid.

Soovitan: